More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4327 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
181 aa  350  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  97.24 
 
 
181 aa  343  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  66.28 
 
 
187 aa  222  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  65.88 
 
 
228 aa  221  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  66.47 
 
 
202 aa  220  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  65.32 
 
 
182 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  67.23 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  61.99 
 
 
174 aa  218  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  64.29 
 
 
200 aa  214  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  64.29 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  62.29 
 
 
178 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  68.02 
 
 
175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  68.57 
 
 
175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  68.57 
 
 
175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  64.33 
 
 
174 aa  210  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  64.33 
 
 
174 aa  204  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  61.85 
 
 
175 aa  204  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  65.29 
 
 
176 aa  202  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  62.57 
 
 
174 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  62.57 
 
 
181 aa  201  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  61.49 
 
 
190 aa  200  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  62.28 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  64.07 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  62.28 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  62.73 
 
 
173 aa  197  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  60.24 
 
 
172 aa  194  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  61.54 
 
 
175 aa  192  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  61.63 
 
 
175 aa  190  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  59.76 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  61.11 
 
 
184 aa  185  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  61.9 
 
 
173 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  57.4 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  59.88 
 
 
172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  61.68 
 
 
173 aa  181  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  61.08 
 
 
212 aa  178  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  54.76 
 
 
203 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  59.56 
 
 
196 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  58.82 
 
 
197 aa  154  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  46.93 
 
 
174 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 
166 aa  134  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  44.05 
 
 
174 aa  124  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 
166 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 
166 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 
175 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  41.04 
 
 
179 aa  117  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  40.72 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  42.26 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 
166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  41.57 
 
 
170 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  38.95 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  39.05 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  36.47 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  42.35 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  43.68 
 
 
168 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 
165 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 
165 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 
165 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  39.88 
 
 
176 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  43.53 
 
 
177 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  41.62 
 
 
165 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
178 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  42.29 
 
 
181 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 
166 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 
165 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  37.21 
 
 
176 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  43.51 
 
 
166 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  43.51 
 
 
166 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  39.2 
 
 
176 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 
182 aa  104  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  42.96 
 
 
173 aa  104  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  42.51 
 
 
174 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  43.24 
 
 
173 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  38.86 
 
 
176 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 
176 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 
174 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 
171 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  38.29 
 
 
176 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 
174 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
173 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  38.46 
 
 
172 aa  101  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 
167 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 
167 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  39.05 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>