More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02410 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  69.36 
 
 
173 aa  218  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  57.23 
 
 
173 aa  205  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  41.62 
 
 
173 aa  134  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  37.79 
 
 
176 aa  130  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  41.88 
 
 
174 aa  124  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 
190 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  40.37 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  39.77 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  35.59 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  37.95 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  40.69 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  37.8 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  39.66 
 
 
228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  37.8 
 
 
166 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  42.55 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  37.8 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  39.26 
 
 
189 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 
166 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  35.88 
 
 
174 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  39.26 
 
 
189 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  39.02 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  38.26 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  35.5 
 
 
176 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 
175 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 
175 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 
175 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  39.39 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  37.8 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 
175 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  35.98 
 
 
181 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 
175 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 
175 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 
174 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  36.91 
 
 
186 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  37.11 
 
 
186 aa  104  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  41.13 
 
 
184 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  37.27 
 
 
203 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 
175 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  33.92 
 
 
175 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  35.84 
 
 
172 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.57 
 
 
187 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  36.02 
 
 
202 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  41.13 
 
 
173 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  39.38 
 
 
174 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 
175 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 
172 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  40.34 
 
 
164 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  35.09 
 
 
170 aa  101  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 
173 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 
173 aa  101  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
178 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 
174 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
173 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 
174 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
173 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
166 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
166 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  39.72 
 
 
200 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 
166 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 
166 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 
175 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  35.26 
 
 
173 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 
175 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  35.5 
 
 
183 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 
166 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  33.99 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  40.43 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  40.6 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  33.9 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  31.18 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  33.9 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  34.42 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  39.85 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 
174 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  37.33 
 
 
184 aa  99  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 
176 aa  99  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  41.6 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  31.79 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  35.9 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  39.73 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  41.22 
 
 
256 aa  97.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  34.48 
 
 
182 aa  97.4  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 
181 aa  97.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  33.53 
 
 
176 aa  97.4  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>