More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4018 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  359  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  39.02 
 
 		 172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  38.86 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  39.75 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  39.31 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  36.59 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  37.89 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  35.63 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00227  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 172 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  44.36 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  40.28 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  36.91 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 166 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  38.56 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  36.57 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  32.21 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2728  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179395  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  33.97 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.84 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  36.91 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  36.91 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  39.38 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  39.38 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>