More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1634 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  347  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  70.52 
 
 		 173 aa  240  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  68.79 
 
 		 173 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  63.58 
 
 		 189 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  58.48 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  57.65 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  45.29 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  42.69 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  39.31 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  36.77 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 175 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  37.21 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  32.75 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  35.63 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  32.02 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 172 aa  97.8  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  42.22 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 174 aa  94.4  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  38.42 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  38.13 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  37.5 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  32.77 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  32.77 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  29.27 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0351  50S ribosomal protein L10  36.49 
 
 		 159 aa  90.9  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  42.65 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  36.91 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35.81 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  37.8 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  34.87 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  37.96 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  36.78 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  37.23 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  37.23 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  37.23 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  37.18 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  35.53 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 176 aa  87.8  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  36.67 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  33.94 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 		 178 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  34.87 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  30.18 
 
 		 175 aa  87.8  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  35.51 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  32.18 
 
 		 176 aa  87.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  33.99 
 
 		 176 aa  87.4  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 228 aa  87.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>