More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0847 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0847  ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  344  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0424  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  190  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000721465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  54.6 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  48.57 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  52.57 
 
 		 176 aa  174  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1941  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0392  50S ribosomal protein L10  43.68 
 
 		 174 aa  160  6e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1708  ribosomal protein L10  49.37 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0962108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1398  50S ribosomal protein L10  45.81 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3171  50S ribosomal protein L10  44.87 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  38.29 
 
 		 176 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  34.93 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  28.9 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  34.72 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  31.71 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  28.31 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  27.71 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  25 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  33.58 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  28.9 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  26.59 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  27.91 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  32.79 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  29.88 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  28.66 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  26.01 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  31.01 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  28.66 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  31.01 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  30.92 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  28.12 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  29.56 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  28.12 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  29.56 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  29.14 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  28.81 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  26.51 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  28 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  31.17 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  25.43 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  30.33 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  30.33 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  28 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  29.07 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  32.09 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  33.6 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  29.88 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  32.06 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  33.6 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  33.6 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  28.66 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  30.2 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  30.2 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  29.75 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  26.32 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  29.75 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  26.92 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  29.05 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  28.32 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  31.94 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  30.87 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  31.54 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  30.57 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  32.39 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  27.17 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  27.38 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  27.88 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  28.38 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  30.38 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  28.92 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  27.27 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  31.15 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  26.29 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  30.34 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  27.59 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  28.38 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  28.67 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  25.9 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  28.38 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  31.15 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  28.38 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>