More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0640 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 169 aa  332  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  54.55 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  53.85 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  39.73 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  40.69 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  32.1 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  45.14 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  32.6 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  32.05 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  32.05 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  32.05 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  34 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  31.87 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  29.49 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  32.52 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  30.32 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  30.32 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  34.69 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  34.19 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  36.3 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  33.79 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  30.95 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  34.69 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  31.97 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  35.34 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  30.67 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  31.97 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  35.61 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  38.62 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  31.82 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  36.11 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  35.34 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0010  50S ribosomal protein L10  30.54 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.76481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  32.21 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  35.86 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  36.51 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  36.51 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  37.76 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  33.95 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  33.77 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  34.84 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  28.85 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  33.97 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  36.73 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  36.73 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  31.29 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  32.31 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  33.1 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  32.69 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  36.23 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  34.44 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  29.49 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  33.85 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  35.38 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  34.38 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  38.28 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  35.97 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0526  50S ribosomal protein L10  34.53 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.142497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  34.03 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  30.52 
 
 		 178 aa  72  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  36.5 
 
 		 197 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>