More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1784 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  60.11 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  55.87 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  55.87 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0357  50S ribosomal protein L10  37.64 
 
 		 178 aa  130  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.395491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  41.24 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  40.45 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  39.44 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  40.78 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  37.99 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  39.2 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  37.29 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  36.87 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  38.89 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  36.87 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  37.64 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.29 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  35.2 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  38.2 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  38.2 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  38.2 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  37.04 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  36.52 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  36.84 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  37.64 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  34.08 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  42.28 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.59 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  33.91 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  39.07 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  41.13 
 
 		 173 aa  98.6  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  33.15 
 
 		 175 aa  98.2  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  36.11 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  36 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  32.3 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  35.75 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  38.3 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  33.33 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  34.27 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 178 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  31.46 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  28.66 
 
 		 166 aa  90.9  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1665  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 157 aa  90.9  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.701017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  39.86 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  37.59 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  34.44 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  32.77 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  32.77 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  31.28 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  32.78 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  38.07 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  36.67 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  36.55 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  30.57 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  31.03 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  36.84 
 
 		 174 aa  84.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  32 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  29.14 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  33.15 
 
 		 256 aa  84.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  32.8 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  31.03 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  36.46 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>