More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0750 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  100 
 
 		 176 aa  340  8e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  88.17 
 
 		 174 aa  287  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  78.36 
 
 		 178 aa  265  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  79.88 
 
 		 184 aa  264  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  81.14 
 
 		 175 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  80.57 
 
 		 175 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  80.57 
 
 		 175 aa  258  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  77.27 
 
 		 179 aa  250  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  76.14 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  70.45 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  65.29 
 
 		 181 aa  222  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  64.37 
 
 		 187 aa  222  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  66.27 
 
 		 202 aa  220  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  65.09 
 
 		 182 aa  217  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  65.29 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  65.87 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  60.23 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  59.54 
 
 		 174 aa  194  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  59.52 
 
 		 228 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  56 
 
 		 176 aa  189  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  58.82 
 
 		 172 aa  185  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  56.02 
 
 		 173 aa  184  7e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  55.95 
 
 		 203 aa  181  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  57.89 
 
 		 173 aa  178  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  53.14 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  53.22 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  51.48 
 
 		 190 aa  174  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  53.85 
 
 		 174 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  56 
 
 		 175 aa  174  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  52.07 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  53.25 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  57.06 
 
 		 173 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  51.48 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  54.32 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  56 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  56.74 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  56.74 
 
 		 197 aa  147  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  43.86 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  42.35 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  48.87 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  42.17 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  43.59 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  45.45 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  41.86 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  42.6 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  45.86 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  40.34 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  43.84 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  40.36 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  42.48 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  42.48 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  43.84 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  40.36 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  37.04 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  43.18 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  38.86 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 173 aa  97.8  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  38.36 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  43.26 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>