More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  100 
 
 		 172 aa  338  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  68.6 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  64.5 
 
 		 176 aa  221  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  64.5 
 
 		 190 aa  220  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  66.86 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  61.76 
 
 		 182 aa  208  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  59.06 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 173 aa  198  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  62.72 
 
 		 173 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  58.82 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  60.82 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  58.24 
 
 		 203 aa  191  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  60 
 
 		 228 aa  191  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  58.43 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  61.05 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  57.4 
 
 		 202 aa  187  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  57.4 
 
 		 172 aa  187  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  59.3 
 
 		 174 aa  187  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  58.82 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 174 aa  185  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  60.23 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  58.33 
 
 		 197 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  60.24 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  57.56 
 
 		 174 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  60.82 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  56.21 
 
 		 178 aa  180  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  57.95 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  56.73 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  56.8 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  56.8 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  58.49 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  57.31 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  59.06 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 200 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  57.14 
 
 		 178 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  42.42 
 
 		 179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  42.6 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  45.24 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  44.59 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  42.28 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38.73 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  43.15 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  42.47 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  35.63 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  41.78 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35.26 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  39.58 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 256 aa  98.2  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  40.14 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  40.14 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 171 aa  95.9  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  32.77 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  31.46 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.81 
 
 		 178 aa  91.3  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  32.34 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>