More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2990 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
196 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  98.1 
 
 
197 aa  289  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  60.12 
 
 
190 aa  194  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  59.41 
 
 
172 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  61.9 
 
 
173 aa  191  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  63.1 
 
 
176 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  55.05 
 
 
203 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  62.99 
 
 
174 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  54.41 
 
 
228 aa  178  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  54.4 
 
 
182 aa  174  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  58.58 
 
 
174 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  59.35 
 
 
175 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  56.47 
 
 
173 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  54.65 
 
 
175 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  54.22 
 
 
173 aa  167  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  56.73 
 
 
174 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  52.02 
 
 
187 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  56.55 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  54.17 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  63.19 
 
 
184 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  56.86 
 
 
184 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  57.32 
 
 
175 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  56.76 
 
 
181 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  53.76 
 
 
181 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  49.72 
 
 
181 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  49.46 
 
 
202 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  53.29 
 
 
174 aa  151  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  50.29 
 
 
173 aa  149  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  51.19 
 
 
200 aa  147  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  52.94 
 
 
178 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  52.98 
 
 
179 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  51.96 
 
 
179 aa  140  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  54.9 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  54.25 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  54.25 
 
 
175 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  54.25 
 
 
175 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  51.47 
 
 
178 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  48.32 
 
 
174 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  42.37 
 
 
179 aa  123  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  45.39 
 
 
174 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  42.77 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  42.48 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  44.51 
 
 
166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  42.18 
 
 
176 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  44.44 
 
 
176 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  41.61 
 
 
176 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  40.79 
 
 
172 aa  104  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  41.98 
 
 
166 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  42.76 
 
 
166 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  42.76 
 
 
166 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  40.65 
 
 
256 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 
173 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 
173 aa  101  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  41.96 
 
 
166 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  41.89 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  38.31 
 
 
174 aa  99  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  41.01 
 
 
173 aa  98.2  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  41.36 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  37.93 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  36.73 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 
172 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  39.47 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  39.47 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
174 aa  95.5  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
173 aa  94.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  38.69 
 
 
174 aa  94.7  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  41.96 
 
 
173 aa  94.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
166 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
186 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  41.5 
 
 
174 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0351  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 
159 aa  94.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  42.34 
 
 
182 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  38.78 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  39.07 
 
 
165 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 
173 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.15 
 
 
172 aa  91.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  39.39 
 
 
172 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
165 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
168 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
168 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
165 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
165 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
165 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  38.07 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  38.46 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>