More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0678 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  100 
 
 
190 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  66.67 
 
 
176 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  64.33 
 
 
172 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  67.06 
 
 
173 aa  216  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  63.22 
 
 
174 aa  214  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  64.57 
 
 
175 aa  206  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  62.65 
 
 
173 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  63.16 
 
 
212 aa  201  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  56.59 
 
 
182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  59.63 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  57.14 
 
 
187 aa  195  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  61.27 
 
 
173 aa  195  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  59.06 
 
 
175 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  60 
 
 
172 aa  194  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  60.82 
 
 
175 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  54.45 
 
 
203 aa  192  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  61.49 
 
 
181 aa  191  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  57.39 
 
 
200 aa  191  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 
196 aa  191  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  57.4 
 
 
184 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  56.21 
 
 
174 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  56.8 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  52.79 
 
 
228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  52.66 
 
 
202 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  57.23 
 
 
184 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  53.85 
 
 
173 aa  174  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  55.06 
 
 
179 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  50.3 
 
 
174 aa  168  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  55.06 
 
 
179 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  52.07 
 
 
173 aa  166  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  52.41 
 
 
181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 
178 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  52.05 
 
 
176 aa  160  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  53.61 
 
 
178 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  50.88 
 
 
175 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  50.59 
 
 
175 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  50.59 
 
 
175 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  43.58 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  43.27 
 
 
174 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 
174 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  43.95 
 
 
175 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  42.24 
 
 
176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.14 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 
178 aa  107  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  38.15 
 
 
173 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  44.81 
 
 
181 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 
174 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  36.78 
 
 
176 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  40 
 
 
170 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 
174 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  37.06 
 
 
172 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 
173 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 
173 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 
174 aa  101  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  39.88 
 
 
176 aa  101  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.97 
 
 
174 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  38.86 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  38.31 
 
 
175 aa  97.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  39.62 
 
 
174 aa  97.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 
166 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.27 
 
 
174 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  40.56 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  33.13 
 
 
173 aa  94.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38.04 
 
 
172 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  35.54 
 
 
256 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 
166 aa  91.7  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 
166 aa  91.7  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 
166 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  31.18 
 
 
172 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  32.14 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  34.94 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  32.14 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  37.01 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 
178 aa  89  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 
166 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  32.48 
 
 
205 aa  88.6  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  41.5 
 
 
167 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.81 
 
 
166 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  41.5 
 
 
167 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.81 
 
 
166 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  39.76 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 
165 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 
166 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 
166 aa  88.2  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  37.04 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 
166 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 
166 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 
166 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 
166 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 
165 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 
165 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>