More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2676 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  100 
 
 
174 aa  340  5.999999999999999e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  82.76 
 
 
174 aa  285  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  54.55 
 
 
169 aa  153  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  43.31 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  38.76 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.93 
 
 
174 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  36.36 
 
 
176 aa  100  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  37.71 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  40 
 
 
172 aa  99  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  38.32 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  34.97 
 
 
172 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 
176 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  36.67 
 
 
174 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  39.07 
 
 
174 aa  91.3  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  40.37 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  38 
 
 
174 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  38.76 
 
 
176 aa  89  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 
186 aa  87.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 
173 aa  87.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  36.57 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  39.74 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.96 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  40.67 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  34.32 
 
 
172 aa  84.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 
165 aa  84  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  37.71 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36.73 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  36.42 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  42.64 
 
 
167 aa  82  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  39.38 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  41.27 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  38.61 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  36.57 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  33.73 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  33.14 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  36.3 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  32.93 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.47 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  35.8 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  33.78 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  32.47 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  35.15 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  37.11 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  38.3 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  38.46 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  32.93 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  38.41 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0256  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651654  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  37.04 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0351  ribosomal protein L10  33.56 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0874946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.76 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.76 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  35.81 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  35.37 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  35.37 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  34 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  38.76 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  39.42 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  34.57 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  34.83 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  31.61 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  36.49 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  32.93 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>