More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0234 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0234  ribosomal protein L10  100 
 
 		 164 aa  323  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.675629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  34.73 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  36.18 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.67 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  32.69 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  31.08 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  34.56 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  34.56 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  33.99 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  34.62 
 
 		 181 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  30.32 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  36.03 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.67 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.67 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  32.35 
 
 		 166 aa  84  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 166 aa  84  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  31.06 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  30.86 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  35.44 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  35.44 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  31.51 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  30.26 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  28.21 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  29.56 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  32.39 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  29.93 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  34 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  35.33 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  31.43 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  31.14 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  30.46 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  28.67 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  30.61 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  32.05 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  30.87 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  29.33 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  30.95 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  29.65 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  28.66 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  35.82 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  28 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  27.49 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  35.82 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  29.79 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  27.04 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  33.81 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  30.61 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  28.17 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  29.41 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  34.21 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  30.22 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  32.76 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  29.93 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  29.93 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  33.1 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  30.13 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  32.26 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  29.93 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  34.23 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0167  50S ribosomal protein L10  31.47 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  30.88 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  32.85 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  30.92 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  33.1 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  29.07 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 195 aa  67.4  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  32.8 
 
 		 212 aa  67  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  30.22 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  29.65 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  31.82 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  29.92 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>