More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04532 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 177 aa  346  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  87.88 
 
 		 178 aa  298  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2198  50S ribosomal protein L10  71.75 
 
 		 175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000455583  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2108  50S ribosomal protein L10  71.19 
 
 		 175 aa  250  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000349119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  54.37 
 
 		 175 aa  170  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  51.25 
 
 		 175 aa  168  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  57.5 
 
 		 175 aa  167  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  52.17 
 
 		 166 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  51.25 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  55 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  45.2 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  45.2 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  51.25 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0208  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000217712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  54.37 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  49.38 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  49.38 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4361  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43206  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4393  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4483  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.763348  hitchhiker  0.0000000000000236313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4557  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  hitchhiker  0.0000000000122855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4480  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  hitchhiker  0.00110307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  47.83 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  47.83 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  47.83 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0195  50S ribosomal protein L10  49.38 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000187486  normal  0.229046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  48.77 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  47.83 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  47.2 
 
 		 195 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  48.12 
 
 		 172 aa  148  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  52.33 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  47.93 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  47.93 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  48.75 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  47.83 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  47.5 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  47.53 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  48.75 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  46.58 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  46.58 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  45.96 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  47.53 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  48.15 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  45.34 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  48.15 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  48.15 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  48.26 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  46.15 
 
 		 168 aa  141  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  45.96 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  47.53 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  46.3 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  46.91 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  47.53 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00227  50S ribosomal protein L10  46.3 
 
 		 178 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  47.53 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  45.68 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  45.96 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  49.07 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  45.86 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  46.05 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  43.29 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  45.68 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2728  50S ribosomal protein L10  47.53 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  43.11 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  43.29 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 178 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>