More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4473 on replicon NC_009037
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 166 aa  326  7e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 166 aa  326  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 166 aa  326  7e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 166 aa  326  7e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 166 aa  326  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  98.8 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  98.8 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  98.8 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  98.8 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  93.98 
 
 		 166 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  92.77 
 
 		 166 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  91.57 
 
 		 166 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  86.67 
 
 		 165 aa  288  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  85.54 
 
 		 166 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  84.94 
 
 		 166 aa  278  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  84.24 
 
 		 165 aa  275  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  78.18 
 
 		 165 aa  256  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  77.58 
 
 		 165 aa  255  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  78.18 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  77.58 
 
 		 165 aa  255  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0208  50S ribosomal protein L10  77.58 
 
 		 165 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000217712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4557  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  hitchhiker  0.0000000000122855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4361  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43206  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4480  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  hitchhiker  0.00110307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  76.97 
 
 		 165 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4393  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406359  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00227  50S ribosomal protein L10  77.11 
 
 		 178 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  77.11 
 
 		 164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4483  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.763348  hitchhiker  0.0000000000000236313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0195  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  251  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000187486  normal  0.229046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  76.36 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  74.7 
 
 		 167 aa  244  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  74.7 
 
 		 167 aa  243  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  75.76 
 
 		 165 aa  243  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  75.76 
 
 		 165 aa  243  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  75.76 
 
 		 165 aa  243  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  76.65 
 
 		 166 aa  242  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2728  50S ribosomal protein L10  73.94 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  73.49 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  75.3 
 
 		 163 aa  235  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  70.48 
 
 		 166 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  70.48 
 
 		 166 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  71.08 
 
 		 166 aa  228  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  69.88 
 
 		 166 aa  226  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  71.08 
 
 		 166 aa  226  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  71.08 
 
 		 166 aa  226  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  71.08 
 
 		 166 aa  226  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  70.48 
 
 		 166 aa  224  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  70.48 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  70.48 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  68.26 
 
 		 164 aa  223  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0500  50S ribosomal protein L10  60.84 
 
 		 166 aa  201  6e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  59.89 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  56.25 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  52.57 
 
 		 175 aa  182  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  53.71 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  53.14 
 
 		 175 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  52.57 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  52.6 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  52.6 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  53.85 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  53.85 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  54.86 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  53.41 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  49.67 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  47.43 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  50.97 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  46.86 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  44.79 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  43.18 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  43.9 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  45.16 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  45.56 
 
 		 172 aa  127  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2198  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000455583  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2108  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000349119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  45.14 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  41.46 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  42.66 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  42.66 
 
 		 179 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>