37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30660 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  49.45 
 
 
313 aa  277  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  48.69 
 
 
312 aa  252  6e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  47.43 
 
 
312 aa  248  7e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  47.55 
 
 
312 aa  241  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  34.87 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  32.26 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  34.58 
 
 
345 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  29.45 
 
 
350 aa  122  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  30.83 
 
 
352 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  28.63 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  26.21 
 
 
334 aa  116  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  26.72 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  26.92 
 
 
346 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  27.08 
 
 
337 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  25.31 
 
 
346 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  29.37 
 
 
343 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  26.8 
 
 
338 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  24.9 
 
 
282 aa  99.4  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  27.89 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  28.74 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  27.89 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  30.43 
 
 
341 aa  97.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  28.69 
 
 
335 aa  95.5  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  27.75 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  29.44 
 
 
344 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  26.29 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  27.89 
 
 
335 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  27.27 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  26.05 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  26.1 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  29.49 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  24.88 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  22.55 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  22.43 
 
 
220 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  20.41 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  23.89 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>