19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90212 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  100 
 
 		 232 aa  480  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134219 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  41.88 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  32.61 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  31.74 
 
 		 220 aa  125  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  31.44 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  22.55 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  27.43 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  24.48 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  23.83 
 
 		 341 aa  52.4  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  25.84 
 
 		 312 aa  52  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  26.02 
 
 		 350 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  22.22 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  22.66 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  22.4 
 
 		 343 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  23.79 
 
 		 312 aa  45.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  23.44 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  24.71 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  22.96 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  22.06 
 
 		 352 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>