41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1654 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 
341 aa  673    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  79.65 
 
 
343 aa  566  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  77.17 
 
 
344 aa  488  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  76.5 
 
 
344 aa  477  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  43.39 
 
 
303 aa  239  5e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  40.43 
 
 
329 aa  213  5.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  39.79 
 
 
294 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  38.44 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  32.1 
 
 
282 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  32.73 
 
 
348 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  31.79 
 
 
345 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  31.52 
 
 
284 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  29.79 
 
 
288 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  34.89 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  30.25 
 
 
350 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  30.74 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  29.64 
 
 
352 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  31.54 
 
 
334 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  29.64 
 
 
345 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  30 
 
 
282 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  32.1 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  30.61 
 
 
335 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  31.07 
 
 
336 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  32.08 
 
 
335 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  28.88 
 
 
338 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  26.62 
 
 
346 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  26.78 
 
 
337 aa  99.8  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  30.43 
 
 
273 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  29.07 
 
 
321 aa  96.3  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  29.15 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  30.26 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  28.02 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  24.8 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  25 
 
 
245 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  24.49 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  23.83 
 
 
232 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  30.61 
 
 
173 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  22.33 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
172 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  35.35 
 
 
179 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  35.35 
 
 
179 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>