145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1636 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 329 aa  657    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  68.86 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  37.39 
 
 		 343 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  39.25 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  40.38 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  40.43 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  38.51 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  38.54 
 
 		 344 aa  172  9e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  32.13 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  30.53 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  32 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  30.8 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  33.46 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  31.05 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  31.65 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  30.91 
 
 		 282 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  29.63 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  32.13 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  28.67 
 
 		 352 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  30.66 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  29.87 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  30.6 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  29.86 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  30.31 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  28.32 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  28.83 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  28.68 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  26.47 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  26.64 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  27.27 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  26.91 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  26.27 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  26.98 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36.67 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  39.36 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.56 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  37.78 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.78 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  37.78 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  37.78 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  30 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  36.17 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  32.74 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  28.97 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  34.04 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  35.56 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  37.84 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 172 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 166 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  34.44 
 
 		 176 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  35.11 
 
 		 174 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 175 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 166 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  35.16 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  32.22 
 
 		 166 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  32.26 
 
 		 181 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  32.58 
 
 		 173 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  36.67 
 
 		 166 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  33 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  32.58 
 
 		 173 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 187 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  30.7 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  27.78 
 
 		 172 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 176 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  36.67 
 
 		 166 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 178 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  28.33 
 
 		 176 aa  50.4  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  32.29 
 
 		 166 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  32.29 
 
 		 166 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  32.29 
 
 		 166 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  34.04 
 
 		 186 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 166 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  37.84 
 
 		 174 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  33.73 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.56 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.56 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  28.78 
 
 		 181 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  30 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  32.26 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  30.59 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  29.79 
 
 		 167 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  34.21 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  28.72 
 
 		 174 aa  47.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  34.44 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  26.67 
 
 		 166 aa  47  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  30.11 
 
 		 187 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 173 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>