38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0613 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 346 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  63.09 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  49.27 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  48.04 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  51.11 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  46.38 
 
 		 282 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  48.38 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  44.41 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  44.77 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  43.79 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  42.49 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  43.86 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  43.66 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  43.21 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  44.01 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  40.41 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  44.12 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  37.57 
 
 		 321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  35.82 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  30.58 
 
 		 288 aa  133  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  29.34 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  30.11 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  25.07 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  26.32 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  28.14 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  25.31 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  27.38 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  27.49 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  23.87 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  25.52 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  25 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  24.44 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  23.7 
 
 		 220 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  21.02 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  28.18 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 		 166 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  25.69 
 
 		 200 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>