35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2185 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  100 
 
 		 352 aa  685    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  74.6 
 
 		 350 aa  464  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  70.72 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  71.81 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  72.05 
 
 		 345 aa  430  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  42.86 
 
 		 346 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  43.99 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  40.86 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  42.09 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  41.03 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  41.24 
 
 		 346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  43.32 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  39.67 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  39.8 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  38.7 
 
 		 338 aa  209  8e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  38.46 
 
 		 336 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  39.6 
 
 		 335 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  36.5 
 
 		 334 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  38.05 
 
 		 321 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  31.64 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  30.8 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 335 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  29.86 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  25.91 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  27.38 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  30.97 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  30.83 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  28.06 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  29.66 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  23.89 
 
 		 313 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  28.03 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  25.98 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  26.87 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  20.81 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>