53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0164 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  70.11 
 
 		 282 aa  411  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  66.06 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  64.89 
 
 		 282 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  59.79 
 
 		 282 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  49.11 
 
 		 337 aa  291  6e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  49.27 
 
 		 346 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  45 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  41.22 
 
 		 348 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  43.46 
 
 		 338 aa  232  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  40.86 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  41.94 
 
 		 345 aa  229  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  43.66 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  44.8 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  41.94 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  43.82 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  45.07 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  40.65 
 
 		 334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  36.88 
 
 		 321 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  35.47 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  32.13 
 
 		 329 aa  158  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  31.73 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  31.91 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  33.94 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  31.56 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  34.04 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  30.42 
 
 		 344 aa  125  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  31 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  28.63 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  27.13 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  26.82 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  25.62 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  25.1 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  20.94 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  29.36 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  32.61 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  32.67 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  32.95 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  32.99 
 
 		 166 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  30.53 
 
 		 174 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  28.18 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  27.78 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  34.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0392  50S ribosomal protein L10  29.35 
 
 		 174 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  31.82 
 
 		 173 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  30.84 
 
 		 165 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  28.42 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  27.78 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 169 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  27.18 
 
 		 178 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  32.93 
 
 		 181 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>