52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0222 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  41.16 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  39.07 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  40.38 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  40.48 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  39.79 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  39.63 
 
 		 344 aa  178  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  41.3 
 
 		 344 aa  171  9e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  34.29 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 348 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  31.84 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  31.73 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  30.71 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  29.78 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  32.28 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  31.64 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  31.56 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 334 aa  145  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  30.42 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  30.83 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  31.73 
 
 		 282 aa  135  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  32.82 
 
 		 338 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  31.16 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  29.34 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  30.07 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  30.43 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  29.96 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  30.8 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  28.74 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  26.55 
 
 		 312 aa  85.5  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  27.01 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  27.62 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  24.63 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  29.35 
 
 		 220 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  30.91 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  24.39 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 173 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  31.46 
 
 		 173 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 172 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  32.61 
 
 		 194 aa  45.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0234  ribosomal protein L10  33.65 
 
 		 164 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.675629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  23.58 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  32.18 
 
 		 174 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  29.21 
 
 		 175 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  24.22 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  36.76 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 181 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>