39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0255 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 350 aa  682    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  73.15 
 
 		 352 aa  468  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  68.57 
 
 		 348 aa  451  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  72.82 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  68.81 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  45 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  45.05 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  43.88 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  43.21 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  42.57 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  45.09 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  41.92 
 
 		 337 aa  230  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  40.88 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  39.16 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  40 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  38.56 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  40.48 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  36.49 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  30.53 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  30.94 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  29.78 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  30.6 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  27.05 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  29.86 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  33.92 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  28.27 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  30.11 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  29.45 
 
 		 273 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  30.1 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  29.46 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  25 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  27.57 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  25 
 
 		 220 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  26.02 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 176 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  21.98 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  37.8 
 
 		 181 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  22.44 
 
 		 245 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>