38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0861 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  100 
 
 		 334 aa  671    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  44.44 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  40.41 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  45.09 
 
 		 346 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  45.26 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  43.2 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  40.66 
 
 		 282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  38.41 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  38.8 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  38.08 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  40.65 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  42.91 
 
 		 282 aa  207  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  40.51 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  38.8 
 
 		 335 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  39.29 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  36.69 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  37.89 
 
 		 345 aa  195  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 352 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  34.07 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  35.5 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  32.2 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  32.5 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  32.52 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  33.21 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  31.3 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  31.2 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  26.32 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  27.13 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  29.78 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  26.86 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  32.89 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  24.49 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  24.4 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  22.66 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  20.69 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  20.3 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>