37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0466 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 343 aa  678    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  78.72 
 
 		 341 aa  527  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  78.84 
 
 		 344 aa  498  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  77.08 
 
 		 344 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  44.75 
 
 		 303 aa  251  9.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  37.39 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  40.48 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  39.86 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  33.8 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  31.18 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  28.98 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  28.98 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  27.55 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  27.86 
 
 		 350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  33.09 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  29.37 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  31 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  28.09 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  26.33 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  30.77 
 
 		 282 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  30.63 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  29.21 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  28.81 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  26.15 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  28.57 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  29.71 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  29.37 
 
 		 273 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  29.15 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  25.44 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  29.13 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  33.15 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  30.34 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  25.81 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  24.15 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  25 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  22.4 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 173 aa  42.7  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>