46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1754 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  44.75 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  43.73 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  44.07 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  43.39 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  41.16 
 
 		 294 aa  225  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  39.07 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  34.3 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  33.68 
 
 		 346 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  33.57 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  35.48 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  34.05 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  31.52 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  30.56 
 
 		 348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  32.04 
 
 		 345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  30.66 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  31.77 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  31.1 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  33.21 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  31.67 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  29.93 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  30.96 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  31.23 
 
 		 321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  30.88 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  31.67 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  30.25 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  31.67 
 
 		 335 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  32.31 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  33.16 
 
 		 312 aa  92.4  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  30.89 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  26.05 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  25.67 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  26.52 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  21.21 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  28.83 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>