34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1947 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 337 aa  680    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  63.09 
 
 		 346 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  50.52 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  49.11 
 
 		 284 aa  292  5e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  50 
 
 		 282 aa  288  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  48.91 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  46.74 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  42.99 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  45.02 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  44.48 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  43.93 
 
 		 335 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  43.73 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  42.72 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  42.77 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  45.02 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  42.27 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  43.61 
 
 		 335 aa  232  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  39.88 
 
 		 321 aa  232  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  41.92 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  32.61 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  33.21 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  31.54 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  29.08 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  27.88 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  27.08 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  25.23 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  26.89 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  27.36 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  27.46 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  26.29 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  23.35 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  25.79 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  25.33 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  24.07 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>