99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0984 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  85.68 
 
 		 413 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  51.01 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  48.3 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 1019 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  45.84 
 
 		 420 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  48.18 
 
 		 408 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  42.22 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  34.41 
 
 		 420 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  31.88 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.4 
 
 		 419 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 403 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  28.68 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  25.78 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  26.05 
 
 		 439 aa  86.3  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  28.07 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.28 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.75 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  28.32 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  21.38 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  24.13 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  30.46 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  26.61 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  30.5 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  27.63 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  29.38 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  25.95 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  25.34 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  30.34 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  28 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  30 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5551  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0620848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  24.83 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.86 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>