88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2789 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  781    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  85.71 
 
 		 402 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  72.39 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  72.64 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  73.4 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  73.3 
 
 		 404 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  67.68 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  52.24 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  60.71 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  58.99 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  55.06 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  55.84 
 
 		 401 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  55.32 
 
 		 401 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  54.06 
 
 		 409 aa  346  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  47.44 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 410 aa  325  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  53.24 
 
 		 414 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  39.45 
 
 		 420 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  38.23 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  36.36 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  28.32 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.69 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  26 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.53 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.63 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  30.2 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  30.5 
 
 		 481 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  28.92 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 1019 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  31.17 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  28.24 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.96 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.08 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.4 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  24.67 
 
 		 472 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  26.74 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.43 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.23 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1971  hypothetical protein  29.63 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 488 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 493 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.38 
 
 		 511 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>