76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0780 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  790    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  39.09 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  38.8 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  35.39 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  30.05 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 482 aa  136  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  30.34 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  31.71 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29.14 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.88 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 398 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  30.85 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.51 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  34.31 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.19 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  27.47 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  29.32 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  29.54 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  27.83 
 
 		 481 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.76 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  26.91 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  37.08 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.21 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>