83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1898 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 409 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  38.08 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 446 aa  219  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 404 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  35.62 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  35.97 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  30.25 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 417 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  36.11 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  38.73 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 402 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  35.35 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 448 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.4 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 424 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  26.13 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.69 
 
 		 464 aa  109  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  32.79 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  30.05 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 413 aa  96.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  26.35 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.72 
 
 		 472 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.64 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  30.07 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.49 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  28.1 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 1019 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  29.05 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 469 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  28.68 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  30.54 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05900  Major Facilitator Superfamily transporter  29.62 
 
 		 429 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.344917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>