82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2206 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  100 
 
 		 417 aa  787    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  51.58 
 
 		 439 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 446 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  35.62 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  32.89 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.82 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  31.59 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  30.16 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  31.62 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 409 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  32.72 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 1019 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.07 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  31.31 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  27.54 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  28.64 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  23.34 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.3 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  25.14 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 469 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  34.42 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  27.03 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  29.46 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  20.33 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  25.14 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  31.21 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>