80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3782 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  783    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  80.88 
 
 		 408 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  76.96 
 
 		 410 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  46.41 
 
 		 407 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  49.88 
 
 		 401 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  50.37 
 
 		 401 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  49.47 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  47.96 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  49.36 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 		 414 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 409 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 414 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  38.6 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 446 aa  229  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  37.77 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  35.95 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 407 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  27.78 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  32.88 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  29 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 412 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.38 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 439 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  29.58 
 
 		 481 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 412 aa  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  27.45 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.68 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  26.25 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  29.22 
 
 		 472 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  26.8 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  26.7 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 1019 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  25.08 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 388 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  24.43 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  30.36 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  29.68 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 442 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>