60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0221 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 392 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  46.07 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  43.85 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  42.39 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  41.94 
 
 		 408 aa  222  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 1019 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  39.38 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.34 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  26.88 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  27.21 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  28.31 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.64 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  23.63 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  23.92 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  26.8 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  25.53 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>