82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1671 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  51.72 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  54.34 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  54.55 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 409 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 		 402 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  53.15 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  52.39 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  55.74 
 
 		 430 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  54.59 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  54.32 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  53.69 
 
 		 404 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  46.59 
 
 		 406 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 405 aa  303  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  44.91 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  37.34 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 448 aa  236  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  40.26 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 404 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  37.15 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  30.09 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.76 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.78 
 
 		 405 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.23 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  30.18 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 439 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  29.15 
 
 		 481 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.49 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  29.32 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  86.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  28.73 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.85 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  31.02 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 1019 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 469 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  25.54 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  32.14 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.76 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  30.72 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>