74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1175 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  100 
 
 		 469 aa  881    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 409 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 446 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  27.03 
 
 		 396 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.81 
 
 		 419 aa  90.5  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  26.83 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  28.76 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  24.05 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.18 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  22.95 
 
 		 439 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 448 aa  67  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 402 aa  62  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  28.27 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.27 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  25.48 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  31.08 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  26.65 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  28.23 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.57 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  20.64 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 404 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.94 
 
 		 472 aa  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.8 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  30.66 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  29.94 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 1019 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  28.07 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>