81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3637 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  46.94 
 
 		 407 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  47.85 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  47.85 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 406 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 410 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  47.44 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 		 404 aa  279  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  46.9 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  41.19 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 417 aa  235  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  38.38 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  36.48 
 
 		 409 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  28.25 
 
 		 439 aa  129  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.59 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  30 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  29.79 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 393 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  26.92 
 
 		 481 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  27.64 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  27.59 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 412 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  29.43 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  27.92 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  25.77 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.15 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  24.31 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 1019 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  28.09 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.71 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 482 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.05 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1971  hypothetical protein  27.56 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>