72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1712 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 396 aa  748    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 399 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 393 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  36.61 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  29.82 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  32.02 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  32.29 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  23.16 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 390 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  29.21 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29.21 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  24.94 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.07 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  27.72 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  30.62 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  32.63 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  22.53 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  27.81 
 
 		 481 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  26.82 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 452 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  29.05 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  19.35 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>