83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6779 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  61.17 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  46.74 
 
 		 409 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  49.73 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  44.5 
 
 		 420 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  46.3 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  36.73 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 402 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 417 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 448 aa  268  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  40.77 
 
 		 401 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  40.26 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 417 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 402 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 410 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 407 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  38.08 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  34.35 
 
 		 439 aa  179  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  29.05 
 
 		 464 aa  162  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  25.61 
 
 		 481 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  29.38 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  31.82 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  32.05 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  30.46 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  31.07 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  29.1 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 430 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  28.88 
 
 		 437 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 1019 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  28.21 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  29.41 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  27.24 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.76 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  23.64 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>