80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5100 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  789    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  54.71 
 
 
407 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  56.22 
 
 
402 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  57.76 
 
 
409 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  55 
 
 
401 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  55.06 
 
 
402 aa  362  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  54.75 
 
 
401 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  57.44 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  55.95 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  55.68 
 
 
402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  55.41 
 
 
402 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  52.2 
 
 
398 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  53.51 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  46.15 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  47.36 
 
 
403 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  51.45 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  53.85 
 
 
404 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  43.16 
 
 
410 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 
408 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 
446 aa  259  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  41.02 
 
 
417 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  38.25 
 
 
420 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  42.78 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 
414 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 
448 aa  243  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
409 aa  242  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  39.9 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  40.54 
 
 
404 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 
402 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  40.16 
 
 
396 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
454 aa  186  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  33.97 
 
 
408 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
403 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 
407 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  30.83 
 
 
439 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  36.02 
 
 
405 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 
412 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  28.21 
 
 
464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
396 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  31 
 
 
393 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  32.74 
 
 
397 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.53 
 
 
419 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  33.08 
 
 
413 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  32 
 
 
395 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 
405 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  31.63 
 
 
404 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  30.92 
 
 
481 aa  97.4  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  29.38 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.23 
 
 
417 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
412 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
1019 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
430 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  30.16 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  30.52 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
413 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
449 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
439 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  27.8 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  28.34 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  29.32 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  33.16 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
452 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  29.68 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  30.46 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  29.41 
 
 
469 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.84 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>