82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3466 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
409 aa  771    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  45.94 
 
 
396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  45.62 
 
 
409 aa  306  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
402 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 
446 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 
414 aa  282  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  42.18 
 
 
420 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 
404 aa  278  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  42.89 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  42.2 
 
 
410 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  37.44 
 
 
407 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 
417 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  41.19 
 
 
401 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  41.19 
 
 
401 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 
417 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  45.58 
 
 
396 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 
408 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 
403 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
402 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  39.51 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  43.7 
 
 
390 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
409 aa  215  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  36.18 
 
 
403 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  35.64 
 
 
408 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  37.47 
 
 
402 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  37.74 
 
 
402 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  38.34 
 
 
406 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 
404 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  37.47 
 
 
430 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  39.62 
 
 
405 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  32.75 
 
 
439 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
414 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  31.47 
 
 
464 aa  184  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 
407 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
412 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  35.64 
 
 
419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
399 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 
454 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 
412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
396 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  33.33 
 
 
407 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
424 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  30.49 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
407 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  32.6 
 
 
404 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  33.09 
 
 
413 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  32.85 
 
 
395 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
430 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  33.99 
 
 
481 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  29.2 
 
 
437 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.03 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.68 
 
 
472 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
425 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  30.22 
 
 
453 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  27.06 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
400 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28.76 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
452 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
439 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  40.35 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
1019 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  28.76 
 
 
408 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  28.33 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  36.05 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  29.14 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.94 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
430 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  29.82 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05140  tetracycline transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07300)  31.86 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>