83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2914 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  754    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  41.98 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 		 409 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  43.19 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  42.67 
 
 		 401 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  37.3 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 399 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  42.16 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  41.04 
 
 		 409 aa  222  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  39.9 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 454 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 406 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  37.2 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  30.3 
 
 		 439 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.52 
 
 		 464 aa  129  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  33.25 
 
 		 419 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  30.59 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 439 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  32.25 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  31 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.11 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  29.52 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  29.32 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  28.3 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  27.06 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  28.54 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  30.33 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  32.43 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  24.68 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>