73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3243 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 388 aa  715    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  76.08 
 
 		 408 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  47.81 
 
 		 413 aa  276  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  43.21 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 1019 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  42.29 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  36.46 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  28.29 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.3 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  32.42 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  29.88 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  30.39 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  28.17 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  30.86 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  30.86 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.24 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  29.85 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 461 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.83 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  24.64 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  29.74 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>