71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1267 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1267  putative permease  100 
 
 		 481 aa  979    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  32.09 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 414 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  27.75 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  24.78 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.88 
 
 		 439 aa  144  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  25.83 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 448 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 417 aa  123  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 408 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  29.85 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 390 aa  87  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  32.85 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  32.37 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  30.52 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  23.53 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  28.71 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  23.22 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  22.2 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  27.5 
 
 		 405 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  22.42 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  22.53 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  23.16 
 
 		 1019 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  22.2 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 396 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 420 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 439 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  25 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 400 aa  43.9  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>