More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2521 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  73.64 
 
 		 607 aa  902    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 610 aa  759    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 598 aa  759    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 596 aa  727    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1019 aa  2045    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 592 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  65.27 
 
 		 590 aa  748    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 604 aa  784    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 600 aa  753    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 590 aa  790    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 579 aa  742    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 599 aa  771    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 600 aa  743    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 601 aa  746    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  57.99 
 
 		 598 aa  702    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  67.7 
 
 		 578 aa  798    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 		 590 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 609 aa  743    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 		 599 aa  781    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  63.42 
 
 		 592 aa  749    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 		 591 aa  760    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  65 
 
 		 601 aa  768    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 584 aa  798    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  63.95 
 
 		 572 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 		 590 aa  743    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 584 aa  720    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  65.59 
 
 		 585 aa  761    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 599 aa  695    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 596 aa  786    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 592 aa  766    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  74.19 
 
 		 604 aa  905    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  65.09 
 
 		 590 aa  756    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  64.26 
 
 		 591 aa  749    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 590 aa  736    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 601 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 586 aa  794    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 590 aa  596  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 592 aa  582  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 602 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 592 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 594 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 586 aa  575  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 590 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 596 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 590 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 600 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01825  hypothetical protein  50.7 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.765739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 598 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 590 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 590 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 590 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 595 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 590 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 598 aa  562  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 599 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 617 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 590 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  558  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 585 aa  558  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 590 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 599 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 591 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 593 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 594 aa  555  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 592 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 596 aa  555  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 594 aa  555  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 599 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 591 aa  552  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 593 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 593 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 601 aa  552  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 593 aa  552  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 608 aa  546  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 598 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 596 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 598 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 589 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 598 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 593 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>