83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3195 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 446 aa  855    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  66.4 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  61.77 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  56.15 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 		 454 aa  327  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  43.36 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  46.09 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 409 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 417 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  43.01 
 
 		 401 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  42.22 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 402 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  34.47 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 410 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 409 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  229  9e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 405 aa  223  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  33.93 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 414 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  31.65 
 
 		 481 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  38.44 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 396 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.2 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  31.46 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 397 aa  117  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  30.56 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.06 
 
 		 407 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 399 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  29.21 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  27.38 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 430 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 407 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 1019 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  28.57 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  30.48 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  28.34 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  31.56 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  25.62 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1971  hypothetical protein  31.5 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05900  Major Facilitator Superfamily transporter  28.25 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.344917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>