39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1971 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1971  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  676    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.65 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
446 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  21.84 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  33.52 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
439 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  31.82 
 
 
396 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  26.23 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  30.16 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  23.72 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  25 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
417 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  30.15 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  31.32 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
414 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  35.85 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
405 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  34.78 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
412 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  26.01 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  28.02 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  23.8 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  44.29 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  27.52 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  24.63 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  25.21 
 
 
401 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  35.79 
 
 
469 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>