82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4875 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  762    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  42.93 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  36.11 
 
 		 407 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 414 aa  232  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  36.91 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  37.76 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 448 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 408 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  37.18 
 
 		 401 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  36.41 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 402 aa  196  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 404 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  37.94 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  32.24 
 
 		 419 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  28.25 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  31.98 
 
 		 472 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  26.56 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  31.02 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  30.69 
 
 		 481 aa  106  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  28.27 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  29.67 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.03 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 449 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  30.91 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 1019 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  28.35 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  27.27 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  28.49 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  29.68 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  29.19 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>