81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3415 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  821    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  49.88 
 
 		 417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  32.9 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.42 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  29.26 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  29.82 
 
 		 420 aa  100  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  31.59 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  31.69 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 409 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.83 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 1019 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  28.17 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  28.39 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  28.68 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.93 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  26.84 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  35.4 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  23.5 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  30.38 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 407 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 444 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  20.09 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 570 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  25.54 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>